mNGS—病原体检测小能手
感染病
由病原微生物如病*、细菌、真菌、螺旋体、衣原体、立克次体和寄生虫等通过不同方式侵入人体导致健康受到损害的疾病，包括传染病和非传染性感染病。
近年，面对病原微生物渐呈多样化和复杂化的特征，加之病原体的检测方法存在局限性，因而感染性疾病的发病率和死亡率仍持续上升。
病原检测的困难性
料不到
-新发、罕见、多重病原感染缺乏检测技术手段。
想不到
-不典型的临床症状，难以预测病原体；-罕见感染性疾病，无法推断对应的病原体。
检不到
-病原含量太低或存在干扰，如儿童结核、成人脑结核、抗菌药物的使用等；-传统方法无法检测到病原体。
NO.01
常见的病原微生物检测方法有哪些？
目前病原微生物的检测方法有生化鉴定、涂片镜检、培养法、免疫学检测和核酸检测等。
传统的感染病检测方法，大多存在检测周期长、检测靶标单一、培养检出率低、病原体难预判等问题。
具统计，在全球范围内，死于疾病的人数中有23%与感染性疾病相关。
因此临床上，需要更全面、快速、精准的检测手段辅助医生对感染病作出及时的诊断和治疗，而mNGS恰好就具备上述的优点。
mNGS是何方神圣？
宏基因组新一代测序技术（metagenomicsnext-generationsequencing,mNGS）以高输出量和高解析度为主要特色，能一次性对几十万到几百万条的DNA分子进行序列读取，该测序技术在提供丰富的遗传学信息的同时，还可大大降低测序费用、缩短测序时间。
来源：《宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识》
NO.02
mNGS的优势是什么？
mNGS检测无需培养，无需预测，直接对临床样本中的核酸进行高通量测序，然后与数据库进行比对分析，根据比对到的序列信息来判断包含的病原微生物种类。
因此mNGS检测技术具有以下优势：
检测临床无法检测的病原体
mNGS检测无需预测即可检测所有病原微生物的核酸序列；
检测游离核酸
在使用过抗菌药物后仍可协助诊断；
检测罕见微生物
为常规方法无法检测的病原体提供了检测方法；
检测时间较部分常规检测技术短
例：分枝杆菌和真菌培养(2天-8周)，生长缓慢的病原菌(5天)，mNGS从样本到报告，24-48小时内即可交付；
一次检测多种微生物
可以一次性对已报道的种DNA病原微生物和种RNA病*进行检测，即一次检测可以代替临床的多项检测。
NO.03
mNGS适用于哪些科室？
重症护理病房
-呼吸道感染
-血流感染
-中枢神经系统感染
感染科、呼吸科
-病原微生物引起的身体症状（如持续低烧）
-未能确诊的患者
儿科
-儿童感染性病原体快速筛查鉴定
泌尿外科、生殖科、男性
-慢性前列腺炎
-睾丸炎
-尿道炎
-膀胱炎
移植科和肿瘤科
-器官移植人群
-肿瘤患者
-免疫力低下人群
不明感染人群
-难培养、罕见或新型致病菌筛查，如不明原因发热
NO.04
mNGS适用于哪些患者？
根据《宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识》所述，具有以下适应症的患者，应尽快将样本送检：
·病情危重需要尽快明确病原体；
·特殊病人如免疫抑制宿主、合并基础疾病、反复住院的重症感染患者需要尽快明确病原体；
·传统微生物检测技术反复阴性且治疗效果不佳；
·疑似新发病原体、临床上提示可能有一定的传染性；
·疑似特殊病原体感染；
·长期发热或伴有其他临床症状、病因不明的感染。
NO.05
mNGS成为一线检测方法的原因？
“对于新发、罕见、疑难的感染性疾病，以及免疫缺陷患者，二代测序能显著提高病原体的检出率，可作为上述疾病的一线检测手段（A，III）。”
“对于慢性中枢神经系统感染及随访病原学证据的患者，可首选二代测序进行检测（A，II）。”
—《中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识》
END
通过本期的“mNGS知多少”栏目，大家对mNGS这位“病原体检测小能手”的认识是不是加深了不少？
下期“美格医学科普讲堂”将继续带大家走进mNGS的世界，记得继续